基础医学院始终坚持有组织科研，打造有方向、有后劲的学科团队，自2018年起实行PI（Principal Investigator）团队管理，鼓励学院教师跨部门、跨学科组建PI团队。学院现有PI团队26个。

  学院现拥有国家发改委工程实验室1个，中国医学科学院重点实验室1个，教育部重点实验室1个。科技部教育部地方高校学科创新引智基地1个，国家级实验教学示范中心1个，教育部虚拟教研室1个。参与建设全省重点实验室1个，牵头或参与建设省级重点实验室4个，贵州省科技厅科学家工作站2个，省级科技合作基地3个，省级科技创新人才团队8个、省级人才基地2个,省发改委工程中心3个。贵州省2011协同创新中心2个，贵州省高等学校特色重点实验实验室5个，贵州省教育厅创新群体1个，创新人才团队5个，省级科普示范基地1个。

2023年至今，获批国家级项目77项，其中国家自然科学基金项目73项，科技部重点研发课题1项，累计经费约2911万元；省部级及以下项目275项，累计经费约3900万元。近三年发表文章381篇，其中一区文章70篇（影响因子≥10分的文章32篇），2区154篇